那曲市是西藏的“北大门”，全国五大牧区的重要组成部分，素有“江河源”“中华水塔”的荣誉。总体上属欠发达、落后地区。[2]地处西藏北部的唐古拉山脉、念青唐古拉山脉和冈底斯山脉之间。中部属高原丘陵地形，西北部海拔较高，北部属唐古拉山区域，东部属高原山地，南部属藏北高原与藏东高山峡谷交汇地带。
距今大约1-5万年，那曲地区属象雄政权。
7世纪前后，那曲地区的东部归属苏毗部落。后来，吐蕃部落统一全藏，建立吐蕃王朝，藏北被纳入其统治。
宋朝，那曲和羊八井、帮仓（今当惹湖和昂则湖一带）、朗如（今班戈县一带）被称作北方四部落。
元至元六年（1269年），元世祖忽必烈派官员在青海到萨斯加主要驿道设置驿站，其中在前藏设置驿站7所，驿道穿越今那曲的巴青、索县、比如、那曲及当雄一带，并派蒙古军士屯驻藏北，以后形成霍尔三十九族的藏北蒙古人势力。
17世纪至18世纪初，属和硕特蒙古政权，并在腾格里湖（纳木错）驻扎蒙古骑兵震慑全藏。
清雍正三年（1725年），清政府设青海办事大臣，委任第十二代“霍尔王”赤加吉钦总管三十九族，直属理藩院夷情衙门。雍正六年（1728年），清廷在拉萨设驻藏大臣办事衙门。雍正九年（1731年），勘定青藏地界，古拉山脉南北两麓诸部落，分归驻藏大臣和青海办事大臣管辖，三十九族划归驻藏大臣直管。乾隆十六年（1751年），在那曲建立坎囊宗，并隶属新建的西藏地方政府噶厦管辖。
民国五年（1916年），噶厦在霍尔地区设置总管，即“霍尔基”。藏历水马年（1942年），噶厦地方政府设立绛恰基巧，管辖藏北牧区和拉萨以北的14个宗，那曲宗即为其中之一。
1950年10月，昌都地区和那曲地区东部解放。
1951年3月，昌都地区人民解放委员会宣告成立，原属噶厦绛曲基巧的聂荣宗、索宗、巴青宗、比如宗、拉日宗、尺牍宗、色扎宗、丁青宗隶属该委员会第一办事处（驻丁青），那曲的中部和西部地区仍由噶厦绛曲基巧管理。
1953年1月，中国共产党西藏工作委员会黑河分工委成立。
1956年10月9日，西藏自治区筹备委员会设立黑河基巧办事处。那曲宗隶属那曲基巧办事处管辖。
1959年，西藏自治区筹备委员会对藏北的行政区划作出重大调整，黑河基巧办事处下辖九个县。10月，筹委会决定撤销各地基巧办事处，设立行政公署。
1960年1月，国务院批准“黑河地区”改名“那曲地区”。2月，黑河专员行政公署成立。
1965年，更名为那曲行署。
1970年，那曲专区改称那曲地区，那曲县由那曲地区管辖。
1985年，国务院批准成立尼玛县。
2012年11月，国务院批准设立双湖县。
2017年10月，撤销那曲地区和那曲县，设立地级那曲市和色尼区。
那曲草甸草原
那曲草甸草原，主要由小嵩草组成，其株高仅3—5厘米，但生长密集。位于青藏高原腹地的那曲草原以辽阔、高寒著称。自然条件严酷，人为干扰弱，自然面貌保存最好。
当惹雍错，位于尼玛县文部南村，海拔4535米，是西藏本教著名的圣湖之一。曾是中象雄的王宫所在地，是藏北象雄遗迹最集中的地区之一。
普若岗日冰川，位于双湖县境内，冰源面积422平方公里，平均冰厚150米左右，最高处海拔6000米，是除南极、北极外，世界第三大陆地冰川，被誉为世界第三极。
赞丹寺，位于索县县城，又被称为“藏北小布达拉”，始建于1667年，属格鲁教派，寺内珍藏大量的佛像、壁画、藏经印册等，具有很高的文物价值和艺术价值 。
